Naiset toimivat keskusliitossa kahdessa työryhmässä, naistyöryhmässä ja metsänomistajanaisten jaostossa.
Naistyötyöryhmä koostuu johtokunnan, valtuuskunnan ja metsävaltuuskunnan sekä maaseutuyrittäjien edustajista. Mukana on asiantuntijana Maa- ja kotitalousnaisten keskuksen toiminnanjohtaja ja ruotsinkielisen tuottajajärjestön edustaja.
Metsänomistajanaisten jaoston jäseninä on edustajat metsänomistajien liittojen alueilta.
Vuoden 2008 alussa aloitti ensimmäinen nainen metsäjohtokunnassa. Hän on Annukka Kimmo Lappeenrannasta. MTK:n johtokunnassa on kaksi naista Kati Partanen Iisalmesta ja Annamari Torttila Hämeenlinnan Lammilta.